De game begint als Link wakker wordt uit een slaap van honderd jaar.
De wereld is drastisch veranderd, als link voor het eerst daglicht
ziet hoort hij Zelda. Zelda verteld dat hij honderd jaar heeft geslapen
en dat hij haar moet redden van Ganon in het kasteel.
Door heel Hyrule zijn verschillende vijanden zoals de zogeheten Bokoblin's
Moblin's en Lynel's. Er veel verschillende dorpen die Link op zijn weg door
Hyrule ontdekt en helpt om uiteindelijk Ganon te verslaan.
Voor dat Link wakker werdt is er veel gebeurt.
Ganon, het terug kerend kwaad van Hyrule
heeft het land over genomen. Hij heeft
duizende monsters vrijgelaten om
Hyrule over te nemen. Ook heeft hij de vier
titanen overgenomen waardoor
het bijna onmogelijk is om hem te stoppen.
Er zijn ook volgers van het kwaad, mensen die niet
gecreërd zijn door Ganon maar wel aanhangers zijn,
deze mensen noemen zichzelf de Yiga clan.